アイソトープ治療センターでは、前立腺癌に対するヨード125シードを用いた永久挿入治療（ブラキセラピー）や口腔癌・外陰癌等に対するCs-137針・Au-198シード・Ir-192ヘアピン等を用いた組織内照射を代表とする密封小線源療法、甲状腺癌に対するヨード内用療法、B細胞非ホジキンリンパ腫に対するアイソトープ標識抗体イブリツモマブ（ゼバリン）を用いた放射性免疫療法、有痛性多発骨転移に対するストロンチウム治療などの各種核医学治療をおこなっています。以上の治療は、放射線科治療グループおよび核医学グループにより実施されます。